管理科学与工程学科是泰勒“科学管理”理论的继续和发展，它以人类社会组织管理活动的客观规律及应用为研究对象，以数学、运筹学、系统工程、电子信息技术等为研究手段，是一门跨自然科学、工程科学和社会科学的综合性交叉学科。我校管理科学与工程学科形成于1986年，于1996年获硕士学位授予权。目前本学科有博士生导师30余名。近五年来承担了国家自然科学基金、国家863项目、国际合作项目等多项科学研究项目，发表论文300余篇，逐渐在多学科交叉交通管理决策理论与方法、航运物流信息处理理论与工程技术、港口和航运系统、集装箱供应链分析与优化、航运产业发展结构优化与战略管理、港口知识工程与智能决策技术、海岸与海洋工程管理等领域形成了学科发展特色与优势。本学科始终坚持以服务上海及各省市航运及物流管理与工程发展为己任，在航运管理人才培养、航运中心建设战略研究、重大港航建设项目技术论证、港口与海洋工程研究等方面为上海及其他省市提供了积极支持，发挥了难以替代的作用。本学科在集疏运体系研究、物流流程优化、港航物流网络设计与系统优化等方面积累了雄厚的基础。

交通运输工程经济与管理

本专业的主要研究方向为：①海运与物流产业经济研究②海运与物流技术经济研究③国际航运中心发展研究

交通管理决策理论与方法

本专业的主要研究内容为：①交通规划一体化决策理论②交通需求管理与决策③交通网络优化

产业管理理论与技术

本专业的主要研究内容为：从国家战略、区域战略、产业战略的高度和角度研究航运产业的发展涉及的一系列结构优化问题，包括航运与相关产业的结构、航运在综合运输体系中与其他运输方式的结构、航运产业内部各组成要素的结构等

运输管理科学

本专业的主要研究内容为：①港口与航运系统决策分析②港口与航运供应链物流管理③航运金融工程理论与方法

供应链管理与实现技术

本专业的主要研究方向为：①航运物流信息处理理论与工程技术②物流供应链分析与优化